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科學分類
,'''生物分类法'''又稱 科學分類法，是用[[生物分类学]]方法來對[[生物]]的[[物種]]分组和歸類的辦法。以级别为基础的系统层次结构中使用的一个固定数量的层次，[[域_(生物)|域]]、[[界 (生物)|界]]、門、綱、目、[[科 (生物)|科]]、[[属 (生物)|属]]和[[物种|种]]。无级别系统使用任意数量的层次。分类的群体被称为[[分类单元]]。
現代生物分類法源於[[林奈]]的系統，他根據物種共有的生理特徵分類。在林奈之後，根據[[查爾斯·達爾文|達爾文]]關於[[共同祖先]]的原則，此系統被逐漸改進。近年來，應用了[[生物信息學]]方法分析[[基因組]][[DNA]]，正在大幅改動很多原有的分類。
生物分類法屬於[[系統分類學]]。
== 現代發展 ==
儘管林奈當時對生物分類只是爲了方便鑒別，現在人們已經廣泛贊同分類應反映出[[達爾文]]關於共同祖先的原則。
隨著1960年代[[支序分類]]（cladistics），或稱分支學說（cladism）的出現，一個分類單元被定位在演化樹的某個位置。如果一個分類單元包括且僅包括某一個共同祖先的所有後代，稱其爲[[單系群]]（monophyly）；相對應的，若該單元包括其共同祖先，但未包括其所有後代，則稱之爲[[併系群]]（paraphyly）；若該分類不包括其最近共同祖先，則稱之爲[[複系群]]（polyphyly）。根據分支學說，一個自然分類應該是單系群而非併系或複系。
目前正在計劃一種新的命名法，稱做「PhyloCode」，用來處理演化支（clade）而非分類單元（拉丁文taxon，複數taxa）。現在仍不清楚，這種新的命名法能否和其它的命名法則並存。
傳統的分類受到[[林奈]]的兩界說影響甚深。即把生物一律分為動物和植物，又以[[王國]](界)來稱呼這兩大分類，可在二十世紀對於微生物和真菌的研究，便被發現其不適用。第一次突破兩界說是1925年以「王國（界）之上是帝國（域）」，借用政治和歷史上的概念，創立「域」的最大分類單位，依照所有生物細胞的有無核，將之分為真核生物和原核生物兩界。但本分類標準當時來說太過前衛了所以影響不大。
比較新的分類法中，[[域 (生物)|域]]或稱[[總界]]是最高的單元。[[三域系統]]最初被創立於1990年，此後逐漸被學界承認。目前，大多數學者已經接受了此系統，但仍有一些學者遵循[[五界系統]]。三域系統的基本特徵是將原本在[[細菌界]]（或稱[[原核生物界]](Monera)中的古細菌和真細菌獨立成[[細菌域]]（Bacteria）和[[古菌域]]（Archaea）。還有一些學者將古細菌列爲第六個[[界 (生物)|界]]但不接受三域系統。
== 早期分類系統 ==
最早已知的對生命形式的分類系統由希臘哲學家[[亞里士多德]]所建立。他將動物根據運動方式（空中，陸上或水中）分類。1172年[[塞維利亞]]的法官[[伊本·路世德]]（ibn Rushd，即[[阿維羅伊]]Averroes）將亞里士多德的《[[論靈魂]]》（拉丁文''de Anima''）翻譯成阿拉伯文並刪節。其原始註解已佚，但由[[斯考特]]（Michael Scot）翻譯的拉丁文版本仍流傳。
在中國，明代[[李時珍]]（約1518–1593）在藥典《[[本草綱目]]》中，將生物藥材分爲草部、穀部、菜部、果部、木部、蟲部、鱗部、介部、禽部、獸部和人部。瑞士教授[[康拉德·格斯纳]]（Conrad Gesner, 1516–1565）將當時已知的生物進行了分析性的歸納。
[[新大陸]]的發現爲歐洲帶來了很多新奇的動物種類的描述和標本。在16世紀晚期和17世紀早期，人們開始對動物進行了詳細描述，先是人們熟悉的種類，隨後逐漸擴展，直到形成了基於[[解剖學]]基礎的足夠大的知識體系。這些解剖學知識主要來源於醫學解剖學家，隨後[[昆蟲學]]家和最初的顯微鏡學者將分類的範圍進一步擴大。
=== 林奈氏分類法 ===
[[卡爾·林奈]]（Carolus Linnaeus, 1707–1778）的巨著《[[自然系統]]》（拉丁文''Systema Naturae''）在其一生中被改編過12次（1735年第一版）。在此書中，自然界被劃分爲三個界：礦物、植物和動物。林奈用了四個分類等級：綱、目、屬和種。
林奈所建立了用於命名所有物種的[[學名]]的方法，並沿用至今。在林奈之前，命名一個物種需要很長的包括許多單詞的名稱，其中包括了對物種的描述，並且這些名稱不固定。林奈將物種名稱統一成兩個单词的拉丁文名稱，即[[學名]]，由此分開了命名法和分類法。這種生物命名的方法稱作[[雙名法]]，具體命名辦法和書寫規則參見'''[[雙名法]]'''條目。
目前，命名法由[[國際植物命名法規|命名法規]]（Nomenclature Codes）所管理。命名包括了不同等級的分類單元的名稱。
儘管在漢語中，各物種及分類單元有對應的漢語名稱，但在學術上爲了方便交流和避免一物多名或一名多物的問題發生，所有國家仍通用拉丁語的命名法，物種的'''學名'''也專指雙名法的名稱。拉丁語的好處在於，它基本已經是一種“[[死語]]”，不再用作口語，因此相對穩定。
== 舉例 ==
常见的五種[[细胞生物]]（[[黑腹果蝇|果蠅]]、[[人]]、[[豌豆]]、[[釀酒酵母]]和[[大腸杆菌]]）的名稱和分類如下：
{| class="wikitable" cellpadding="4" cellspacing="0" style="margin: 0.5em 1em 0.5em 0;"
|-
! 中文
! 英文
! 拉丁文<br />(單數, 複數)
! [[黑腹果蝇|果蠅]]
! [[人]]
! [[豌豆]]
! [[釀酒酵母]]
! [[大腸桿菌]]
|-
| '''域'''；'''總界'''
| domain; <br />superkingdom
| {{lang|la|regio, regiones}}
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[細菌域]]<br /> Bacteria
|-
| '''界'''
| kingdom
| {{lang|la|regnum, regna}}
| [[動物界]]<br /> Animalia
| [[動物界]]<br /> Animalia
| [[植物界]]<br /> Plantae
| [[真菌界]]<br /> Fungi
| [[細菌界]]<br /> Bacteria
|-
| '''門'''
| division（植物）; <br />phylum（动物）
| {{lang|la|divisio, divisiones; <br />phylum, phyla}}
| [[節肢動物門]]<br /> Arthropoda
| [[脊索動物門]]<br /> Chordata
| [[被子植物門]]<br /> Magnoliophyta
| [[子囊菌門]]<br /> Ascomycota
| [[變形菌門]]<br /> Proteobacteria
|-
| 亞門
| subdivision; <br />subphylum
| {{lang|la|subdivisio, subdivisiones; <br />subphylum, subphyla}}
| [[六足亞門]]<br /> Hexapoda
| [[脊椎動物亞門]]<br /> Vertebrata
|
|
|
|-
| '''綱'''
| class
| {{lang|la|classis, classes}}
| [[昆蟲綱]]<br /> Insecta
| [[哺乳綱]]<br /> Mammalia
| [[雙子葉植物綱]]<br /> Dicotyledoneae
| [[酵母綱]]<br /> Saccharomycetes
| [[γ-變形菌綱]]<br /> Gammaproteobacteria
|-
| 亞綱
| subclass
| {{lang|la|subclassis, subclasses}}
| [[新翅亞綱]]<br /> Neoptera
| [[獸亞綱]]<br /> Eutheria
| [[薔薇亞綱]]<br /> Rosidae
|
|
|-
| '''目'''
| order
| {{lang|la|ordo, ordines}}
| [[雙翅目]]<br /> Diptera
| [[靈長目]]<br /> Primates
| [[豆目]]<br /> Fabales
| [[酵母目]]<br /> Saccharomycetales
| [[腸桿菌目]]<br /> Enterobacteriales
|-
| 亞目
| suborder
| {{lang|la|subordo, subordines}}
| [[短角亞目]]<br /> Brachycera
| [[簡鼻亞目]]<br /> Haplorrhini
|
|
|
|-
| '''科'''
| family
| {{lang|la|familia, familiae}}
| [[果蠅科]]<br /> Drosophilidae
| [[人科]]<br /> Hominidae
| [[豆科]]<br /> Fabaceae
| [[酵母科]]<br /> Saccharomycetaceae
| [[腸桿菌科]]<br /> Enterobacteriaceae
|-
| 亞科
| subfamily
| {{lang|la|subfamilia, subfamiliae}}
| [[果蠅亞科]]<br /> Drosophilinae
| [[人亞科]]<br /> Homininae
| [[蝶形花亞科]]<br /> Faboideae
|
|
|-
| '''屬'''
| genus
| {{lang|la|genus, genera}}
| [[果蠅屬]]<br /> ''Drosophila''
| [[人屬]]<br /> ''Homo''
| [[豌豆屬]]<br /> ''Pisum''
| [[酵母屬]]<br /> ''Saccharomyces''
| [[埃希氏菌屬]]<br /> ''Escherichia''
|-
| '''種'''
| species
| {{lang|la|species, species}}
| [[黑腹果蠅]]<br /> ''D. melanogaster''
| [[智人]]<br /> ''H. sapiens''
| [[豌豆]]<br /> ''P. sativum''
| [[釀酒酵母]]<br /> ''S. cerevisiae''
| [[大腸桿菌]]<br /> ''E. coli''
|}
註：
* 表中很多分類尚有分歧，除細菌參照[https://web.archive.org/web/20160510051339/http://bergeys.org/instructions.html 伯傑氏手冊]的分類大綱外，其餘按照傳統分類，未有統一標準，謹作參考。
* 植物學和微生物學家用系統方法對較高級的分類單元命名，即用[[拉丁文]]中[[模式屬]]（type genus）屬名的[[詞幹]]加上標準的詞尾來命名這個單元（見下表）。例如，[[薔薇科]]的“科長”（即模式屬）是薔薇屬(''Rosa'')，其詞幹爲“Ros-”，則薔薇科的拉丁名即爲“Ros-”加上植物的科的後綴“-aceae”成爲“Rosaceae”。中文的大多數分類單元也是類似用法，但：
*# 中文所用爲高級單元的取名的屬可能和拉丁文不同，如[[牻牛兒苗科]](Geraniaceae)的中文名來源於[[牻牛兒苗屬]](''Erodium'')，但其拉丁名來源於[[老鸛草屬]](''Geranium'')。
*# 拉丁名變更後中文名不一定變更。如[[脣形科]]拉丁名原根據形態命名爲Labiatae，現根據標準改爲Lamiaceae，取名源自[[野芝麻屬]](''Lamium'')，中文也不必將脣形科改譯作“野芝麻科”。
* 動物學家通常只將類似命名法命名至科（包括總科）這一級，以上則多用描述法。
現代生物分類法源於[[林奈]]的系統，他根據物種共有的生理特徵分類。在林奈之後，根據[[查爾斯·達爾文|達爾文]]關於[[共同祖先]]的原則，此系統被逐漸改進。近年來，應用了[[生物信息學]]方法分析[[基因組]][[DNA]]，正在大幅改動很多原有的分類。
生物分類法屬於[[系統分類學]]。
== 現代發展 ==
儘管林奈當時對生物分類只是爲了方便鑒別，現在人們已經廣泛贊同分類應反映出[[達爾文]]關於共同祖先的原則。
隨著1960年代[[支序分類]]（cladistics），或稱分支學說（cladism）的出現，一個分類單元被定位在演化樹的某個位置。如果一個分類單元包括且僅包括某一個共同祖先的所有後代，稱其爲[[單系群]]（monophyly）；相對應的，若該單元包括其共同祖先，但未包括其所有後代，則稱之爲[[併系群]]（paraphyly）；若該分類不包括其最近共同祖先，則稱之爲[[複系群]]（polyphyly）。根據分支學說，一個自然分類應該是單系群而非併系或複系。
目前正在計劃一種新的命名法，稱做「PhyloCode」，用來處理演化支（clade）而非分類單元（拉丁文taxon，複數taxa）。現在仍不清楚，這種新的命名法能否和其它的命名法則並存。
傳統的分類受到[[林奈]]的兩界說影響甚深。即把生物一律分為動物和植物，又以[[王國]](界)來稱呼這兩大分類，可在二十世紀對於微生物和真菌的研究，便被發現其不適用。第一次突破兩界說是1925年以「王國（界）之上是帝國（域）」，借用政治和歷史上的概念，創立「域」的最大分類單位，依照所有生物細胞的有無核，將之分為真核生物和原核生物兩界。但本分類標準當時來說太過前衛了所以影響不大。
比較新的分類法中，[[域 (生物)|域]]或稱[[總界]]是最高的單元。[[三域系統]]最初被創立於1990年，此後逐漸被學界承認。目前，大多數學者已經接受了此系統，但仍有一些學者遵循[[五界系統]]。三域系統的基本特徵是將原本在[[細菌界]]（或稱[[原核生物界]](Monera)中的古細菌和真細菌獨立成[[細菌域]]（Bacteria）和[[古菌域]]（Archaea）。還有一些學者將古細菌列爲第六個[[界 (生物)|界]]但不接受三域系統。
== 早期分類系統 ==
最早已知的對生命形式的分類系統由希臘哲學家[[亞里士多德]]所建立。他將動物根據運動方式（空中，陸上或水中）分類。1172年[[塞維利亞]]的法官[[伊本·路世德]]（ibn Rushd，即[[阿維羅伊]]Averroes）將亞里士多德的《[[論靈魂]]》（拉丁文''de Anima''）翻譯成阿拉伯文並刪節。其原始註解已佚，但由[[斯考特]]（Michael Scot）翻譯的拉丁文版本仍流傳。
在中國，明代[[李時珍]]（約1518–1593）在藥典《[[本草綱目]]》中，將生物藥材分爲草部、穀部、菜部、果部、木部、蟲部、鱗部、介部、禽部、獸部和人部。瑞士教授[[康拉德·格斯纳]]（Conrad Gesner, 1516–1565）將當時已知的生物進行了分析性的歸納。
[[新大陸]]的發現爲歐洲帶來了很多新奇的動物種類的描述和標本。在16世紀晚期和17世紀早期，人們開始對動物進行了詳細描述，先是人們熟悉的種類，隨後逐漸擴展，直到形成了基於[[解剖學]]基礎的足夠大的知識體系。這些解剖學知識主要來源於醫學解剖學家，隨後[[昆蟲學]]家和最初的顯微鏡學者將分類的範圍進一步擴大。
=== 林奈氏分類法 ===
[[卡爾·林奈]]（Carolus Linnaeus, 1707–1778）的巨著《[[自然系統]]》（拉丁文''Systema Naturae''）在其一生中被改編過12次（1735年第一版）。在此書中，自然界被劃分爲三個界：礦物、植物和動物。林奈用了四個分類等級：綱、目、屬和種。
林奈所建立了用於命名所有物種的[[學名]]的方法，並沿用至今。在林奈之前，命名一個物種需要很長的包括許多單詞的名稱，其中包括了對物種的描述，並且這些名稱不固定。林奈將物種名稱統一成兩個单词的拉丁文名稱，即[[學名]]，由此分開了命名法和分類法。這種生物命名的方法稱作[[雙名法]]，具體命名辦法和書寫規則參見'''[[雙名法]]'''條目。
目前，命名法由[[國際植物命名法規|命名法規]]（Nomenclature Codes）所管理。命名包括了不同等級的分類單元的名稱。
儘管在漢語中，各物種及分類單元有對應的漢語名稱，但在學術上爲了方便交流和避免一物多名或一名多物的問題發生，所有國家仍通用拉丁語的命名法，物種的'''學名'''也專指雙名法的名稱。拉丁語的好處在於，它基本已經是一種“[[死語]]”，不再用作口語，因此相對穩定。
== 舉例 ==
常见的五種[[细胞生物]]（[[黑腹果蝇|果蠅]]、[[人]]、[[豌豆]]、[[釀酒酵母]]和[[大腸杆菌]]）的名稱和分類如下：
{| class="wikitable" cellpadding="4" cellspacing="0" style="margin: 0.5em 1em 0.5em 0;"
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! 中文
! 英文
! 拉丁文<br />(單數, 複數)
! [[黑腹果蝇|果蠅]]
! [[人]]
! [[豌豆]]
! [[釀酒酵母]]
! [[大腸桿菌]]
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| '''域'''；'''總界'''
| domain; <br />superkingdom
| {{lang|la|regio, regiones}}
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[真核域]]<br /> Eukarya
| [[細菌域]]<br /> Bacteria
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| '''界'''
| kingdom
| {{lang|la|regnum, regna}}
| [[動物界]]<br /> Animalia
| [[動物界]]<br /> Animalia
| [[植物界]]<br /> Plantae
| [[真菌界]]<br /> Fungi
| [[細菌界]]<br /> Bacteria
|-
| '''門'''
| division（植物）; <br />phylum（动物）
| {{lang|la|divisio, divisiones; <br />phylum, phyla}}
| [[節肢動物門]]<br /> Arthropoda
| [[脊索動物門]]<br /> Chordata
| [[被子植物門]]<br /> Magnoliophyta
| [[子囊菌門]]<br /> Ascomycota
| [[變形菌門]]<br /> Proteobacteria
|-
| 亞門
| subdivision; <br />subphylum
| {{lang|la|subdivisio, subdivisiones; <br />subphylum, subphyla}}
| [[六足亞門]]<br /> Hexapoda
| [[脊椎動物亞門]]<br /> Vertebrata
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| '''綱'''
| class
| {{lang|la|classis, classes}}
| [[昆蟲綱]]<br /> Insecta
| [[哺乳綱]]<br /> Mammalia
| [[雙子葉植物綱]]<br /> Dicotyledoneae
| [[酵母綱]]<br /> Saccharomycetes
| [[γ-變形菌綱]]<br /> Gammaproteobacteria
|-
| 亞綱
| subclass
| {{lang|la|subclassis, subclasses}}
| [[新翅亞綱]]<br /> Neoptera
| [[獸亞綱]]<br /> Eutheria
| [[薔薇亞綱]]<br /> Rosidae
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| '''目'''
| order
| {{lang|la|ordo, ordines}}
| [[雙翅目]]<br /> Diptera
| [[靈長目]]<br /> Primates
| [[豆目]]<br /> Fabales
| [[酵母目]]<br /> Saccharomycetales
| [[腸桿菌目]]<br /> Enterobacteriales
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| 亞目
| suborder
| {{lang|la|subordo, subordines}}
| [[短角亞目]]<br /> Brachycera
| [[簡鼻亞目]]<br /> Haplorrhini
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| '''科'''
| family
| {{lang|la|familia, familiae}}
| [[果蠅科]]<br /> Drosophilidae
| [[人科]]<br /> Hominidae
| [[豆科]]<br /> Fabaceae
| [[酵母科]]<br /> Saccharomycetaceae
| [[腸桿菌科]]<br /> Enterobacteriaceae
|-
| 亞科
| subfamily
| {{lang|la|subfamilia, subfamiliae}}
| [[果蠅亞科]]<br /> Drosophilinae
| [[人亞科]]<br /> Homininae
| [[蝶形花亞科]]<br /> Faboideae
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| '''屬'''
| genus
| {{lang|la|genus, genera}}
| [[果蠅屬]]<br /> ''Drosophila''
| [[人屬]]<br /> ''Homo''
| [[豌豆屬]]<br /> ''Pisum''
| [[酵母屬]]<br /> ''Saccharomyces''
| [[埃希氏菌屬]]<br /> ''Escherichia''
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| '''種'''
| species
| {{lang|la|species, species}}
| [[黑腹果蠅]]<br /> ''D. melanogaster''
| [[智人]]<br /> ''H. sapiens''
| [[豌豆]]<br /> ''P. sativum''
| [[釀酒酵母]]<br /> ''S. cerevisiae''
| [[大腸桿菌]]<br /> ''E. coli''
|}
註：
* 表中很多分類尚有分歧，除細菌參照[https://web.archive.org/web/20160510051339/http://bergeys.org/instructions.html 伯傑氏手冊]的分類大綱外，其餘按照傳統分類，未有統一標準，謹作參考。
* 植物學和微生物學家用系統方法對較高級的分類單元命名，即用[[拉丁文]]中[[模式屬]]（type genus）屬名的[[詞幹]]加上標準的詞尾來命名這個單元（見下表）。例如，[[薔薇科]]的“科長”（即模式屬）是薔薇屬(''Rosa'')，其詞幹爲“Ros-”，則薔薇科的拉丁名即爲“Ros-”加上植物的科的後綴“-aceae”成爲“Rosaceae”。中文的大多數分類單元也是類似用法，但：
*# 中文所用爲高級單元的取名的屬可能和拉丁文不同，如[[牻牛兒苗科]](Geraniaceae)的中文名來源於[[牻牛兒苗屬]](''Erodium'')，但其拉丁名來源於[[老鸛草屬]](''Geranium'')。
*# 拉丁名變更後中文名不一定變更。如[[脣形科]]拉丁名原根據形態命名爲Labiatae，現根據標準改爲Lamiaceae，取名源自[[野芝麻屬]](''Lamium'')，中文也不必將脣形科改譯作“野芝麻科”。
* 動物學家通常只將類似命名法命名至科（包括總科）這一級，以上則多用描述法。