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生物信息学

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'''生物信息学'''([[英语]]:bioinformatics)利用[[应用数学]]、[[信息学]]、[[统计学]]和[[计算机科学]]的方法研究[[生物学]]的问题。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据,其研究工具是[[计算机]],研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理([[编辑]]、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)。目前主要的研究方向有:序列比对、序列组装、基因识别、[[基因]]重组、[[蛋白质]]结构预测、基因表达、蛋白质反应的预测,以及创建进化模型。
生物学技术往往生成大量的嘈杂数据。与数据挖掘类似,生物信息学利用数学工具从大量数据中提取有用的生物学信息。生物信息学所要处理的典型问题包括:重新组装在[[霰弹枪]]定序法 <ref>[https://iask.sina.com.cn/b/iRK5CoWTmLU1.html 霰弹枪定序法是怎样的?],爱问</ref> 测序过程中被打散的DNA序列,从蛋白质的[[氨基酸]]序列预测蛋白质结构,利用mRNA微阵列或[[质谱仪]]的数据检验基因调控的假说。
某些人将计算生物学作为生物信息学的同义词处理;但是另外一些人认为[[计算生物学]]和生物信息学应当被当作不同的条目处理,因为生物信息学更侧重于生物学领域中计算方法的使用和发展,而计算生物学强调应用[[信息学]]技术对生物学领域中的假说进行检验,并尝试发展新的理论。
生物信息学可以定义为对[[分子生物学]]中两类信息流的研究:
第一类信息流源于分子生物学的中心法则:DNA序列被转录为mRNA序列,后者被翻译为蛋白质序列。蛋白质序列继而折叠为具功能的三维结构。按照[[达尔文]]演化理论,这些功能被生物体的环境所选择,从而驱动群体中DNA序列的进化 <ref>[https://zhuanlan.zhihu.com/p/151685216 加拿大留学生物信息学专业申请解读],知乎</ref> 。因此,第一类的生物信息学应用关注于中心法则中任一阶段的信息传递,包括DNA序列中基因的组织与控制、确定DNA中的转录单位、从序列预测蛋白质结构以及分子功能分析。
第二类信息流是基于[[科学]]方法:提出关于生物学活动的假设,设计实验以验证这些假设,评估结果与假设的兼容性,然后根据实验数据对原假设作扩展或修正。第二类的生物信息学应用关注于这一流程中的[[信息传]]递,包括产生假设、设计实验、通过数据库将实验结果组织起来、检验数据与模型的兼容性以及修正假设的各个系统。 
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