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''' 乌鲁木齐海关 ''' ，始建于1944年，当时称“新疆关”， 由国民政府海关总税务司署设立。1950年3月9日， [[ 中华人民共和国 ]] 海关总署发布通令，将“新疆关”更名为“中华人民共和国迪化关”；1954年2月13 日，海关总署电令“迪化关”更名为“乌鲁木齐关”；1981年8月1日，正式称为“中华人民共和国乌鲁木齐海关”。1984年9月，经国务院批准，乌鲁木齐海关为正厅局级海关。

2018年3月，中央作出深化党和国家机构改革的部署，明确 [[ 国家质量监督检验检疫总局 ]] 的出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关总署。2018年4月，原新疆出入境检验检疫局完成机构转隶，正式划入乌鲁木齐海关。

截至2019年4月，国家批准的对外开放18个口岸均为一类口岸，其中，航空口岸3个，陆地边境口岸15个。航空口岸有乌鲁木齐航空口岸、喀什航空口岸、伊宁航空口岸。陆路口岸中，新疆与蒙古的边境口岸4个，即老爷庙口岸（哈密地区）、乌拉斯台口岸（ [[ 昌吉回族自治州 ]] ）、塔克什肯口岸（阿勒泰地区）和 [[ 红山嘴口岸 ]] （阿勒泰地区）；新疆与哈萨克斯坦的边境口岸5个，吉木乃口岸（阿勒泰地区）、巴克图口岸（塔城地区）、阿拉山口口岸（博尔塔拉蒙古自治州）、霍尔果斯口岸（ [[ 伊犁哈萨克自治州 ]] ）、都拉塔口岸（伊犁哈萨克自治州）；新疆与吉尔吉斯共和国的边境口岸2个，即吐尔尕特口岸（克孜勒苏柯尔克孜自治州）、伊尔克什坦 [[ 口岸 ]] （克孜勒苏柯尔克孜自治州）；新疆与巴基斯坦的边境口岸1个，即红其拉甫口岸（喀什地区）；新疆与塔吉克斯坦的边境口岸1个，即卡拉苏口岸（喀什地区）。未开放的陆地边境口岸2个，分别是阿黑土别克口岸、木扎尔特口岸，正在建设的航空口岸1个，即 [[ 伊宁机场 ]] 航空口岸。

=== 内设机构===

办公室、法规处、监管通关处、关税处、综合统计处、 [[ 技术 ]] 处、稽查处、风险管理处、人事教育处、财务处、关务保障处、政工办（机关党办、 [[ 工会 ]] 、团委）、监察审计室、缉私局。

=== 派驻机构===

审单处、现场业务处、驻出口加工区办事处、驻 [[ 车站 ]] 办事处、驻库尔勒办事处。

阿拉山口海关、 [[ 喀什海关 ]] 、霍尔果斯海关、吐尔尕特海关、红其拉甫海关、 [[ 伊宁海关 ]] 、塔城海关、阿勒泰海关、伊尔克什坦海关、都拉塔海关、霍尔果斯国际边境合作中心海关、 [[ 机场 ]] 海关和石河子海关。其中喀什海关为副厅级海关。

机关服务中心、中国电子 [[ 口岸 ]] 数据中心 [[ 乌鲁木齐 ]] 数据分中心、海关总署乌鲁木齐教育培训基地。乌缉私局隶属机构