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2018年3月，中央作出深化党和国家机构改革的部署，明确[[国家质量监督检验检疫总局]]的出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关总署 <ref>[https://www.sohu.com/a/229307892_100132331 出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关，上海口岸开放迎来新篇章 ]，搜狐，2018-04-24 </ref> 。2018年4月，原新疆出入境检验检疫局完成机构转隶，正式划入乌鲁木齐海关。

截至2019年4月，国家批准的对外开放18个口岸均为一类口岸，其中，航空口岸3个，陆地边境口岸15个。航空口岸有乌鲁木齐航空口岸、喀什航空口岸、伊宁航空口岸。陆路口岸中，新疆与蒙古的边境口岸4个，即老爷庙口岸（哈密地区）、乌拉斯台口岸（[[昌吉回族自治州]]）、塔克什肯口岸（阿勒泰地区）和[[红山嘴口岸]] <ref>[https://www.sohu.com/a/159392862_676592 新疆最全的15个边境口岸信息，你想知道的都在这里！ ]，搜狐，2017-07-23 </ref> （阿勒泰地区）；新疆与哈萨克斯坦的边境口岸5个，吉木乃口岸（阿勒泰地区）、巴克图口岸（塔城地区）、阿拉山口口岸（博尔塔拉蒙古自治州）、霍尔果斯口岸（[[伊犁哈萨克自治州]]）、都拉塔口岸（伊犁哈萨克自治州）；新疆与吉尔吉斯共和国的边境口岸2个，即吐尔尕特口岸（克孜勒苏柯尔克孜自治州）、伊尔克什坦[[口岸]]（克孜勒苏柯尔克孜自治州）；新疆与巴基斯坦的边境口岸1个，即红其拉甫口岸（喀什地区）；新疆与塔吉克斯坦的边境口岸1个，即卡拉苏口岸（喀什地区）。未开放的陆地边境口岸2个，分别是阿黑土别克口岸、木扎尔特口岸，正在建设的航空口岸1个，即[[伊宁机场]]航空口岸。