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台灣 一名年約3歲的小弟弟，因罹患發炎性腸道疾病持續腹瀉血便而住院，又診斷出被高度抗藥性的困難梭菌感染，經常規抗生素治療無效，仍反覆感染，於長庚醫院接受「便便療法」，健康糞便捐贈者是自己的姊姊，以內視鏡方式將姐姐的腸道菌叢植入該病童腸道，狂腹瀉、血便症狀緩解許多，也順利改善腸道菌相的平衡。此案例為該院迄今接受便便療法的最小年齡病患。 2018年9月 衛福 部2018年9月 部 發布「特定醫療技術檢查檢驗醫療儀器施行或使用管理辦法（簡稱特管辦法）」，新增微菌叢植入術治療嚴重或反覆性困難梭菌感染(rCDI)。這項治療技術是透過將健康捐贈者的腸道菌叢，以灌腸、內視鏡或口服膠囊方式植入病人腸道，以恢復其腸道菌相平衡，達到治療效果。目前開放施行適用於反覆性或常規治療無效之困難梭菌感染病人。<ref>[https://www.setn.com/News.aspx?NewsID=568543 3歲弟染「困難梭菌」 狂拉肚子、血便　姊捐糞救奏效]三立新聞網</ref>