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盛寅的主要醫學著作有《醫經秘旨》兩卷，另著《流光集》（又名《盛御醫集》），已佚。《醫經秘旨》為醫經類著作，上卷為醫論，下卷包括讀醫經的感想和臨證心得19篇。這19篇中討論了《內經》所涉及的治則問題，其中有“以寒治寒”、“以熱治熱”、“以補治積”、“以益氣治滿”、“以寒散表”、“以涼平理氣”、“以溫補止血”、 “以攻下及補益治發熱”等反治法和權變治法，並結合臨證經驗，辨明疑似，以便後學者有所遵循，並可觸類旁通。