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绍兴七年(1137年)召对，高宗嘉纳，特授[[左议郎]]。因与宰相[[ 秦桧]] 相忤，外放越州教授;经浙江制置使梁汝嘉奏请，改为参谋官。他积极协助梁汝嘉审办饥民案件。后又召入任王宫教授，终因忤逆秦桧，被诬陷免官。家居福州10余年，亲自点校家藏书籍数万卷。

绍兴三十年(1160年)，奉派知贡举;又密奏高宗立太子事，同年二月，高宗诏授参知政事。次年，加左通奉大夫，任尚书右仆射同平章事，进封开国公。此时，金主完颜亮率重兵南下，朱倬提出战(主动出战)、备(积极防守)、应(迎战)三策，高宗称"所言三策，甚当。朕书于座右，朝夕思之"。于是，御驾亲征，进驻镇江，他亦随行，取得"采石大捷"。[[ 高宗]] 返回临安后，想传位给太子 [[ 赵眘 ]] ，朱倬认为不可;但高宗主意已定，朱倬便辞去相位。

[[ 绍兴]] 三十二年(1162年)六月，改任观文殿大学士，提举江州(今江西南昌)太平兴国宫。孝宗即位，知其反对禅位事，降为资政殿学士。朱倬回到福州，住太平公辅坊(今三牧坊)。后隐居[[福州]][[ 琅岐龙台]] ，病卒。孝宗得知朱倬病故，内心十分愧疚，下诏复其原职，照宰相恤典办理，加赠特进，谥"文靖"。葬于福州祭酒岭五里梅亭。大儒魏了翁作神道碑文，文革时墓被毁。