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[[File:数学院.jpg|350px|缩略图|右|<big>数学院</big>[http://ss.zhongguancun.com.cn/u/cms/sc/201308/27180309kwbp.jpg 原图链接][http://ss.zhongguancun.com.cn/kyys/1392.jhtml 来自 科研院所 的图片]]]

中国科学院数学与系统科学研究院有国家数学与交叉科学中心、科学与工程计算国家重点实验室、中科院管理决策与信息系统重点实验室、中科院系统控制重点实验室、中科院数学机械化重点实验室、华罗庚数学重点实验室、随机复杂结构与数据科学重点实验室、中科院晨兴数学中心和中科院预测科学研究中心等国家级和院部级实验室和研究中心。

《应用数学学报》是中国数学会主办的中国一流的学术刊物，创刊于1976年，主要刊登国际、中国应用数学及相关领域有关理论、方法或应用方面的研究论文，注重论文的创新性及学术水平。《中国科学引文索引》将该刊作为数据库来源期刊，《中国数学文摘》、《中国学术期刊文摘》和《中国科学技术期刊文摘数据库》（CSTA）等都为该刊作文摘索引。中国国外数学领域有重要影响的数学文摘刊物，如美国数学会的《数学评论》（MR）、俄罗斯的《数学文摘》、英国的《科学文摘》（SA）及德国的《数学文摘》等也都为该刊作文摘。在该刊上发表的文章已成为内地及香港各大、专院校及科研机构晋级、评奖和评定职称的重要依据。