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二期工程始于南坪快速路一期的塘朗立交桥，经沙河西路、南头、前海深港现代服务业合作区至兴海大道，全长15.4公里，当中由塘朗至南头，全长11.178公里的南坪快速路（二期）A段工程（1－4标段）于2012年7月31日通车，二期A段南头立交至同乐立交及B段，截至2018年8月仍未建成通车 <ref>[https://www.sohu.com/a/299170450_100191048 深晚报道｜南坪二期什么时候能通车？最新消息来了 ]，搜狐，2019-03-04</ref> ，工期延误原因分别是由于A段5标段（中山园段）拆迁赔偿无法达成一致，中山园段需改线沿平南铁路正上方高架，按规定只能在没有[[列车]]通过的铁路天窗期内施工；B段则因前海深港现代服务业合作区获批，前海区域规划变更，道路[[设计]]改为地下；A段6标段（南头立交）已经建成，因为5标段未建成而与其余路段无法联通，现处于闲置中。[[广东省]][[人民政府]]办公厅回应查询时指2018年年底可通车。后来延至2021年通车。

三期工程由水官高速横坪立交向东伸延，由水官高速横坪立交起，经碧岭工业区至[[坪山新区]]聚龙路（规划中的[[深圳外环高速公路]]田头立交），全长22.2公里，其中从水官高速至碧岭工业区为双向六车道，长约8.5[[公里]]，部分路段利用横坪公路改造，而碧岭工业区至聚龙路为双向八车道，长约13.7公里，为新建路段。全段共设置15座互通立交。水官高速横坪立交至碧岭工业区段已随新横坪公路于2018年1月25日亮灯，碧岭至龙坪路立交段于2019年1月30日通车 <ref>[https://www.sohu.com/a/292418472_100191055 南坪三期横坪立交—龙坪立交段1月30日正式开通 ]，搜狐，2019-01-30 </ref> ，龙坪立交-外环高速立交段于2020年1月7日开放通行，至此，南坪快速路三期工程已全线贯通。