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罗吉尔·培根生于英国[[萨默塞特郡]]伊尔彻斯特的伊尔彻斯特修道院。具体的出生时间已无法确定，唯一相关的记载是他在1267年的著作中说“从我第一次接触字母表，至今已历40年”，而他在13岁进入[[牛津大学]]读书是确定的，于是研究者假设他在进入牛津之前不认识字母表，从而推定他的出生时间是1213或1214年。如果他进入牛津之前已经识字，那他的出生时间应该是1220年年以后<ref name="Hackett">{{Citation|last = Hackett | first = Jeremiah| |year = |title = Roger Bacon: His Life, Career, and Works |language = en}}</ref>。培根的家境比较富裕，但是在[[亨利三世 (英格兰)|亨利三世]]在位期间，家里的很多财产被掠夺，一些家庭成员被流放。
培根在牛津大学就读时可能曾师从[[罗伯特·格罗斯泰斯特]]，后在牛津大学讲授[[亚里斯多德]]的思想。没有证据证明他拿到了 [[ 博士 ]][[ 学位 ]] ，他的“万能博士”的称号是死后才有的。1237-1245年之间他曾前往 [[ 欧洲 ]] 学术研究中心之一 [[ 法国]][[巴黎大学]]任教。1247年他回到了牛津大学，购买了很多书籍和仪器，谢绝社会和学术活动，开始自己的研究。大约1256年他成为[[方济各会]]修士，从此失去教职。1260年更是受到方济各会的禁令，要求他不能随便出版书籍{{R|Hackett|page=13-17}}。
培根受到的科学教育和他自己的研究使他看到了当时学术争论的很多缺陷：没有教师懂得[[希腊文]]，使得他们仅仅通过低劣的翻译来了解亚里士多德的思想。物理学并不像亚里士多德提倡的通过实验来研究，而是对典籍进行争论。目睹这一切的培根反对这种空洞的争论，提倡实验的重要性，并且出于他直率的个性，他到处宣扬他认为正确的方法，猛烈抨击他所不同意的，这给他带来了很多的麻烦。1256年培根一向抨击的[[康沃尔的理查德]]开始担任英国方济各会的首脑。不久，培根被转到法国的一所修道院。此后十年他只能通过写信和朋友们交流。