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研究所下设科学数据研究室、情报研究室、文献资源研究室、古籍资源研究室、多媒体资源研究室、信息技术研究室及== 出版中心。现有职工155人。是国家教育部中医药图书、情报硕士研究生培养点，是世界卫生组织（WHO）传统医学临床与情报合作中心单位之一，是全国中医药图书情报工作委员会主任单位，国家中医药管理局中国中医药文献检索<ref>[http://news.sohu.com/a/503245945_121123712 一文教你如何进行文献检索] ，搜狐，2021-11-24</ref>中心，是国家科技部科学数据共享平台—医药卫生科学数据管理与共享服务网中的中医药科学数据中心，以及中国中医药信息研究会、中国卫生经济学会中医药分会和北京中医药学会计算机专业委员会的挂靠单位。