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仙游县有铬、铌、钽、铅锌、钨、铝、铁、锰、 [[ 金沙 ]] 、黄铁矿等，但储量较少，且多为品位低的小矿点，开采难度较大。其中铁和锰储量较多。

[[ 高岭土 ]] ：全县地质远景储量2000万吨，[[钟山镇]]远景储量1000～2000万吨，其探明储量387.87万吨，量多质优、粒度细小、化学成份稳定，很有开采价值。1985年，仙游县高岭土开发公司在土城埔办厂投产。

[[ 陶土 ]] ：分布于盆地及低平的水田底下，质优量多。榜头、龙华、盖尾、城东、大济、石苍等地储量最多，是烧制砖瓦和陶瓷器的原料。

[[ 石英闪长岩 ]] （俗称“青头石”）：是仙游县最重要的非金属矿产，分布地区很广。木兰溪沿岸、丘陵、平原等地区都有，其色青灰，中粒、颗粒均匀，坚硬美观易加工，是很好的建筑材料。

[[ 钾长石花岗岩 ]] （俗称“大麦石”）：主要分布于后坂、何岭、钟山等地，其结晶粗大多晶洞，质较脆，质地比石英闪长岩差。以上两种建筑材料，全县储量有8亿立方米以上。易开采的有1.2亿立方米。

[[ 花岗斑岩 ]] ：多成脉状产出（也称大麦石），也是建筑材料。

仙游县 [[ 野生动植物资 ]] 源比较稳定。宋宝佑《仙溪志》记有植物71种，动物23种；明[[弘治]]《兴化府志》记有植物301种，动物234种；清[[乾隆]]《仙游县志》记有植物284种，动物82种。

仙游县现存的陆栖野生动物有两栖类、爬行类、鸟类、哺乳类等脊椎和无脊动物共计1200多种，淡水鱼类有65种， [[ 海洋鱼类 ]] 多数是沿海岸性次级经济鱼类。

现属国家保护的珍贵野生动物有：属国家二级保护的有[[穿山甲]]、[[猕猴]]、水獭、[[鸳鸯]]等；属国家三级保护的有[[大灵猫]]、小灵猫、豹猫、[[青羊]]等。凤山的 [[ 角怪 ]] 属世界珍稀动物。

全县植物品种总计有171科，共2876种。其中，藻菌类11科，43属，计划性92种苔藓类4科，5属，计28种；蕨类15科，23属，125种；裸子植物类7科，8属，计81种；孢子植物134科，250属，计2350种。列为国际性国家级保护的珍贵植物有26种。其中，属国家一级保护的有[[水杉]]；属国家二级保护的有[[银杏]]（分布社硎、菜溪等地）、水松（分布仙游山、麦斜、五湖等地）、福建柏、胡桃、格木、[[杜仲]]、金钱松、楠木、铁刀木、云南石梓、红豆杉、山腊梅、青梅、巴戟、[[荔枝]]、小勾儿茶、异形玉叶金花等17种；属国家三级保护的有油杉（分布梧椿、潭边等地）、[[天竺桂]]、木荚红豆树、[[黄杞]]、厚朴、闹阳花、 [[ 龙眼 ]] 等8种。

仙游县溪流蜿蜒曲折、短小、湍急，落差大，易涨易退，属山地性溪流。历史上，境内通航小木船，从会仙（ [[ 鲤城 ]] ）至俞潭（今[[盖尾仙潭]]），水程30公里。水力资源蕴藏量为26万千瓦，可供开发利用的有200多处，全部开发利用后，装机容量可达17.43万千瓦，年发电量可达6.52亿千瓦时。绝大多数溪流发源于境内，合流或分流出境，分属木兰溪、 [[ 大樟溪 ]] 、枫慈溪、晋江东溪、沧溪等五条溪，其中，主要属[[木兰溪]]水系。