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中國科學院深海科學與工程研究所（簡稱深海所）成立於2011年，由海南省人民政府、三亞市人民政府和中國科學院三方聯合共建，位於中國海南省三亞市鹿回頭半島。

中國科學院深海科學與工程研究所依靠深海工程技術與裝備、實驗平台和基礎設施，結合所處的區位優勢，開展相關深海科學問題研究。作為中國科學院在海洋科學與技術領域的總體單位，深海所不僅開展與深海有關的科學問題研究，同時以深海觀測方法與儀器設備、深海潛器技術、海洋資源開發與利用為主要研究方向，重點發展與海洋科學研究、深海開發結合密切的深海工程技術與裝備，從裝備、條件和設施上支撐開展深海科學和海洋工程的研究。

根據2019年2月研究所官網顯示，中國科學院深海科學與工程研究所科研園區建設用地約109畝，科研園區總建築面積50183.95平方米，生活輔助設施建設用地約90畝，生活園區134259.60平方米；截至2018年12月31日，全所在冊職工192人，其中崗位聘用146人、項目聘用40人、博士後6人；全所下設2個研究部門，分設13個基本研究和技術支撐單元。

歷史沿革

2011年，中國科學院啟動籌建研究所，海南省人民政府、三亞市人民政府和中國科學院三方聯合共建。

2013年，中國科學院深海科學與工程研究所「深海地質與地球化學研究室」、「深海極端環境模擬研究實驗室」、「深海探測技術研究室」成立。

2014年10月，中國科學院深海科學與工程研究所「深海地球物理與資源研究室」成立。12月，「深海信息技術研究室」成立。同年，「海洋環流觀測與數值模擬研究室」、「深海資源開發研究室」成立。

2015年6月，研究所正式獲得中編辦批覆，定名為「中國科學院深海科學與工程研究所」。

2016年3月，中國科學院深海科學與工程研究所「深海視頻技術研究室」成立。11月，研究所與海南中學順利簽署合作共建協議暨 「海南中學綜合實踐基地」 授牌儀式。

2017年8月，中國科學院依託深海所，籌建中國科學院深海技術創新研究院。

2018年2月，中國科學院深海科學與工程研究所與深圳華大生命科學研究院簽署戰略合作協議。7月，海南省「海智計劃」中國科學院深海科學與工程研究所工作站正式揭牌成立。11月，中國科學院深海科學與工程研究所與中國地質調查局廣州海洋地質調查局在深海所簽署戰略合作協議。

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