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祖孝孫，隋唐時樂律學家。
出生於河北范陽祖氏家族，父祖崇儒，官至齊州長史。祖孝孫精曆算數學。隋初開皇年間任協律郎，參定雅樂、京房律法。曾向陳山陽太守毛爽學習「京房律法」。唐初任太常少卿，教宮女音樂。教得不好，宮女沒有長進，太宗責怪孝孫。王珪與溫彥博替祖孝孫辯解：「孝孫雅士，今乃令教宮人，更加譴責，毋乃非宜。」太宗更加生氣，王珪據理力爭。《新唐書》有傳。
武德九年(626)唐高祖「詔太常少卿祖孝孫,協律郎竇等定樂」,至貞觀二年(628)樂成。按隋代宮廷中鍾樂的十二律，「其五鍾設而不擊，謂之啞鍾」。經祖氏家學的律學理論與張文收的「耳決之明」相結合，才在實踐中真正解決了調律和十二律旋宮的問題，自此成為唐以後歷代樂律志中的千古美談。
貞觀十四年(640)，張文收繼祖孝孫業績,再次定樂而受頒賜之時，孝孫已故，除有關《音樂志》、《禮樂志》載有他的學說之大要外，他的所有律學著述都沒能傳下來。
祖孝孫，唐樂律學家。范陽（今涿州）人。隋開皇年間任協律郎，參定雅樂，曾奉命向陳山陽太守毛爽學習「京房律法」。入唐，歷任著作郎，吏部郎、太常少卿等。武德九年（626年），受詔與協律郎竇進等定樂。其律學著述多亡佚，部分篇章收在《音樂志》、《禮樂志》中。