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中國農業科學院深圳農業基因組研究所（Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences）成立於2014年，是由中國農業科學院和深圳市共同打造的現代創新型研究所，為深圳市二類事業法人單位。

基因組所面向國家重大戰略需求和國際農業基因組學研究前沿，以「農業生物組學」、「系統生物學和合成生物學」、「全基因組設計育種」和「農業宏基因組研究與利用」等4個領域為研究重點，設置了「農業動植物基因組學」等研究方向。

截至2017年5月，基因組所下設5個職能管理處室；擁有在職職工100餘人。

歷史沿革

2014年4月25日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所在深圳大鵬新區掛牌成立；同年，獲批成為深圳市二類事業法人單位。

2015年，正式獲得中編辦批覆，是中國國內專門從事農業基因組學研究的國家級研究所。

2016年8月，取得中央事業單位法人證書，；10月，獲得財政部批覆的中央預算戶頭，並開設中央國庫支付賬戶。同時，成立了中央所黨委、完成了研究所機構設置，並與深圳市溝通完成了幹部協管、屬地管理等事項。

科研條件

人員編制

截至2017年4月，研究所在職職工100餘人，其中科技人員90人，高級專業技術職務人員22人。基因組所到位人員85人，包括國家傑出青年基金獲得者3人、973計劃首席科學家3人、國家萬人計劃入選者4人，廣東省「珠江學者」1人、深圳市國家級領軍人才8人和海外高層次B類人才4人、農科院院青年英才15人，還打造了全基因組學貫穿團隊，組建了院創新團隊10個、深圳孔雀團隊1個。

據2018年8月基因組所官網顯示，基因組所已引進基因組研究人才200餘人，包括國家傑青、973首席以及萬人計劃等國家和省部級人才40餘人。

科研部門

截至2017年5月，研究所建設了1個農業部重點實驗室，1個深圳市重點實驗室，建設了深圳中農京躍生物技術有限公司、國家農業基因組科技創新聯盟。

農業部重點實驗室：農業基因數據分析重點實驗室

深圳市重點實驗室：農業基因組表型分析與利用重點實驗室

設備設施

截至2018年7月，Illumina的Miseq、Hiseq2500和Hiseq3000測試儀，測序量每周可以達2.5T的數據，相當於830個人類基因組數據；分子生物學公共平台擁有熒光定量PCR儀、超速離心等大型儀器設備，具備了開展分子生物學實驗研究的基本條件。

截至2016年底，綜合實驗基地建成水稻育種試驗區、溫室、網室、冷藏室1萬餘平米，建設了30畝菊花資源圃。

科研成就

綜述

據2018年8月基因組所官網顯示，基因組所在Science、Nature 、Cell等頂級學術期刊上發表SCI論文100餘篇，申請專利20餘項，審定國審品種2個、省審品種6個；共獲得各級科技經費超過2億元，國家和省市級項目160餘項，重大和重點項目20餘項，國家級項目30餘項。

2015年，該所職工以第一作者或通訊作者在SCI、EI、中文期刊累計發表文章共18篇。其中，院選頂尖SCI核心期刊3篇，院選核心SCI期刊12篇，中文期刊1篇，申請發明專利一項。

代表性成果

熊國勝研究員和樊偉研究員為第一作者的成果入選科技部評選出的「2014年度中國科學十大進展」。

2014年7月和9月，錢前、熊國勝研究員在水稻品質調控方面的研究取得了突破，文章先後發表在Nature Genetics和Molecular Plant上；黃三文研究員在黃瓜卷鬚發育的機制、番茄生物鐘調控機制，為培育蔬菜新品種提供了指導；黎志康團隊完成了3000份國際水稻資源的重測序的工作，完成2000份水稻導入系的SNP基因型鑑定及表型鑑定和1500份水稻核心種質基因組的生物信息分析；徐建龍團隊培育的優質高產水稻新品種「廣兩優7203」已在試驗基地進行示範種植，同時在廣西、廣東、湖北等地已開展示範種植展示，向周邊省市進行推廣；阮珏研究員的三代測序組裝算法和樊偉研究員的變異檢測算法也取得突破。

2023年2月，由中國農業科學院深圳農業基因組研究所動物功能基因組學創新團隊聯合北京畜牧獸醫研究所等單位培育的中農巴馬小型豬3個實驗用小型豬專門化品系近日被認定為中國實驗動物新資源，收錄於國家實驗動物模型資源信息平台。

2023年，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內科研單位成功開發新型DNA斷裂檢測技術（DEtail-seq）。利用此技術，研究人員成功繪製了釀酒酵母、小鼠和人類的減數分裂DNA雙鏈斷裂圖譜。相關研究成果發表在《中國科學—生命科學（Science China-Life Sciences）》上。

2023年5月4日，頂尖學術期刊《細胞》報道了中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊的最新研究成果，題為「利用進化基因組學鑑定有害突變進而指導雜交馬鈴薯育種」。該研究發明了一種新的「進化透鏡」技術，能夠及早發現阻礙馬鈴薯育種的基因組「暗礁」，避免育種「走錯路」。該成果標誌着我國馬鈴薯育種率先進入基因組設計育種新時代。

（Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences）成立於2014年，是由中國農業科學院和深圳市共同打造的現代創新型研究所，為深圳市二類事業法人單位。

基因組所面向國家重大戰略需求和國際農業基因組學研究前沿，以「農業生物組學」、「系統生物學和合成生物學」、「全基因組設計育種」和「農業宏基因組研究與利用」等4個領域為研究重點，設置了「農業動植物基因組學」等研究方向。

截至2017年5月，基因組所下設5個職能管理處室；擁有在職職工100餘人。

歷史沿革

2014年4月25日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所在深圳大鵬新區掛牌成立；同年，獲批成為深圳市二類事業法人單位。

2015年，正式獲得中編辦批覆，是中國國內專門從事農業基因組學研究的國家級研究所。

2016年8月，取得中央事業單位法人證書；10月，獲得財政部批覆的中央預算戶頭，並開設中央國庫支付賬戶。同時，成立了中央所黨委、完成了研究所機構設置，並與深圳市溝通完成了幹部協管、屬地管理等事項。

科研條件

人員編制

截至2017年4月，研究所在職職工100餘人，其中科技人員90人，高級專業技術職務人員22人。基因組所到位人員85人，包括國家傑出青年基金獲得者3人、973計劃首席科學家3人、國家萬人計劃入選者4人，廣東省「珠江學者」1人、深圳市國家級領軍人才8人和海外高層次B類人才4人、農科院院青年英才15人，還打造了全基因組學貫穿團隊，組建了院創新團隊10個、深圳孔雀團隊1個。

據2018年8月基因組所官網顯示，基因組所已引進基因組研究人才200餘人，包括國家傑青、973首席以及萬人計劃等國家和省部級人才40餘人。

科研部門

截至2017年5月，研究所建設了1個農業部重點實驗室，1個深圳市重點實驗室，建設了深圳中農京躍生物技術有限公司、 國家農業基因組科技創新聯盟。

農業部重點實驗室：農業基因數據分析重點實驗室

深圳市重點實驗室：農業基因組表型分析與利用重點實驗室

設備設施

截至2018年7月，Illumina的Miseq、Hiseq2500和Hiseq3000測試儀，測序量每周可以達2.5T的數據，相當於830個人類基因組數據；分子生物學公共平台擁有熒光定量PCR儀、超速離心等大型儀器設備，具備了開展分子生物學實驗研究的基本條件。

截至2016年底，綜合實驗基地建成水稻育種試驗區、溫室、網室、冷藏室1萬餘平米，建設了30畝菊花資源圃。

科研成就

綜述

據2018年8月基因組所官網顯示，基因組所在Science、Nature 、Cell等頂級學術期刊上發表SCI論文100餘篇，申請專利20餘項，審定國審品種2個、省審品種6個；共獲得各級科技經費超過2億元，國家和省市級項目160餘項，重大和重點項目20餘項，國家級項目30餘項。

2015年，該所職工以第一作者或通訊作者在SCI、EI、中文期刊累計發表文章共18篇。其中，院選頂尖SCI核心期刊3篇，院選核心SCI期刊12篇，中文期刊1篇，申請發明專利一項。

代表性成果

熊國勝研究員和樊偉研究員為第一作者的成果入選科技部評選出的「2014年度中國科學十大進展」。

2014年7月和9月，錢前、熊國勝研究員在水稻品質調控方面的研究取得了突破，文章先後發表在Nature Genetics和Molecular Plant上；黃三文研究員在黃瓜卷鬚發育的機制、番茄生物鐘調控機制，為培育蔬菜新品種提供了指導；黎志康團隊完成了3000份國際水稻資源的重測序的工作，完成2000份水稻導入系的SNP基因型鑑定及表型鑑定和1500份水稻核心種質基因組的生物信息分析；徐建龍團隊培育的優質高產水稻新品種「廣兩優7203」已在試驗基地進行示範種植，同時在廣西、廣東、湖北等地已開展示範種植展示，向周邊省市進行推廣；阮珏研究員的三代測序組裝算法和樊偉研究員的變異檢測算法也取得突破。

2023年2月，由中國農業科學院深圳農業基因組研究所動物功能基因組學創新團隊聯合北京畜牧獸醫研究所等單位培育的中農巴馬小型豬3個實驗用小型豬專門化品系近日被認定為中國實驗動物新資源，收錄於國家實驗動物模型資源信息平台。

2023年，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內科研單位成功開發新型DNA斷裂檢測技術（DEtail-seq）。利用此技術，研究人員成功繪製了釀酒酵母、小鼠和人類的減數分裂DNA雙鏈斷裂圖譜。相關研究成果發表在《中國科學—生命科學（Science China-Life Sciences）》上。

2023年5月4日，頂尖學術期刊《細胞》報道了中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊的最新研究成果，題為「利用進化基因組學鑑定有害突變進而指導雜交馬鈴薯育種」。 該研究發明了一種新的「進化透鏡」技術，能夠及早發現阻礙馬鈴薯育種的基因組「暗礁」，避免育種「走錯路」。該成果標誌着我國馬鈴薯育種率先進入基因組設計育種新時代。

人才培養

教學建設

3M鵬博計劃旨在吸引海內外一流的優秀博士畢業生來所從事博士後研究；博士後在站三年間，提供100萬的工資和補貼、100萬科研經費和100萬創業股權投資基金（出站時需有創業基礎）。人才培養==

教學建設

3M鵬博計劃旨在吸引海內外一流的優秀博士畢業生來所從事博士後研究；博士後在站三年間，提供100萬的工資和補貼、100萬科研經費和100萬創業股權投資基金（出站時需有創業基礎）。