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蛻皮動物總門（Ecdysozoa）是一大類原口動物，包括節肢動物門、線蟲動物門[1] 和幾個小門。最初由Auinaldo等人於1997年定義，主要根據是18S 核糖體RNA樹。而這個分類同時也被一系列形態學證據所支持，因爲這個分類包括所有蛻掉几丁质表皮的動物。與蛻皮動物接近的定義也曾經被Perrier在1897年和Seurat在1920年僅依據形態作出。
形态特征
蛻皮動物最顯著的共同特徵是一個三層的表皮（英文cuticle），由有機物組成，能夠隨著動物生長週期性蛻掉。蛻皮動物由此得名。蛻皮動物缺乏運動纖毛，產生變形蟲樣精子，其胚胎不像其他原口動物一樣螺旋卵裂。蛻皮動物的一些分支還有其它一些共同特徵，比如緩步動物和線蟲動物都有一個三輻射對稱的咽。
内部分类
蛻皮動物包括如下門：節肢動物門、有爪動物門、緩步動物門、動吻動物門、鰓曳動物門、鎧甲動物門、線蟲動物門和線形動物門。其它一些門類，比如腹毛動物門，曾被認爲可能是其中的一員，但因其缺乏蛻皮動物的主要特徵，現在通常被劃出。泛節肢動物的共同特徵是具有分節的身體，原來以爲由環節動物演變而來，而與其一起組成分節動物(Articulata)。然而它們並不具有太多的共同特徵，現在看來他們分別演化出了分節的特點。此外，從18S 核糖體RNA樹來看，後口動物中的毛顎動物門可能與其餘後口動物不同而屬於蛻皮動物。蛻皮動物中不屬泛節肢動物的成員曾經被組成環神經動物（Cycloneuralia），但通常被認爲是並系群。
補充
蜕皮动物是指所有会产生蜕皮现象动物的总称，其中还包括线虫、节肢动物和蠕虫，两个被研究得最为透彻的的分子生物学模式生物线虫和果蝇都属于蜕皮动物，在强大的遗传学研究技术支持下，这两种模式生物为生物学研究做出了巨大贡献，其中涵盖了从细胞基本原理到系统学分析等一系列主题，而且，这些研究对我们理解生物学的重要性毋庸置疑。虽然上面罗列了这些研究的意义，但越来越多的证据正在挑战以下这些不言而喻的假说：这些研究结果能适用于大部分的无脊椎动物，或可以通过这些研究结果来推断较简单的祖先动物的代谢过程。相反，这些数据表明，现存的模式蜕皮动物的一些简单特征是祖先复杂结构发生二次简化的结果。
尽管一些蜕皮动物类群很少保留祖先的复杂性，但它们仍进化出迷人的复杂特征。例如，果蝇唐氏综合征细胞粘附分子(Dscam)基因的内含子含量很高，在所有已鉴定的生物中剪接变异体数目最多。黑腹果蝇的Dscam能将特定的物质传给迁移神经元，并协调同种抗原排斥，这是建立神经回路的重要前提。Dscam基因的转录产物在一些群体（包括甲壳动物水蚤）中表现出较高的多样性，表明Dscam基因可变剪接导致细胞多样性的形成，这可能是节肢动物拥有的一个基本功能。与此相反，脊椎动物中Dscam同源基因似乎并没有出现广泛的可变剪接，虽然它们似乎也存在有同种抗原相互作用现象。 这个例子说明，在衡量动物的复杂性时，即使是基于定量分子分析，仍需要区分它们是保留了祖先的复杂特征还是二次得到的复杂特征。还不清楚这两种变化方式的相互关系，因此判定某个物种或类群的复杂性时需要估计它们的进化起源时间。同样值得注意的是，昆虫和线虫都具有非常高的多样性，而且昆虫是动物中物种最丰富的类群，尽管昆虫丢失了一些复杂的特征，它们却进化出了非常高的形态复杂性和多样性。但是，在海洋环境中昆虫的多样性并不算很高，其他蜕皮动物类群（包括甲壳类动物和自由生活的线虫）在海洋中丰度更高，然而适用于它们的悔洋模型和分子学数据仍然非常稀缺。