深圳機場站,是穗深城際鐵路的終點站[1],位於深圳寶安國際機場地面交通中心西側地下,靠近深圳地鐵11號線的機場站,兩者之間距離約300米,現已設置地下通道使之聯通。
本站與深圳地鐵11號綫之連結地下通道長達近400米,故如需由穗深城際鐵路換乘深圳地鐵11號線而非前往深圳寶安國際機場,則在深圳機場北站換乘更加方便。