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'''石灰藻'''是珊瑚礁中最重要的造礁生物之一, 包括了]]藍綠藻]]、[[紅藻]]、[[綠藻]]、[[褐藻]]的成員。石灰藻中的[[碳酸鈣]][[結晶]]有[[方解石]]和[[霰石]]兩種型式。一個與外界隔離的環境是 [[ 鈣化 ]] 的基本要件, 但解釋藻類鈣化機制的假說有很多, 主要有二氧化碳利用理論、重碳酸鹽利用理論和有機基質理論。鈣化對石灰藻具有適應上的重要性。

藻礁自然便是由藻類所建構的礁體是來自植物，是石灰藻類沈積碳酸鈣而成的，藻礁的建造者為種類眾多的石灰藻類（calcareous algae）；當石灰藻在較為固定或堅硬的基質表面生長時，經由鈣化作用沈積碳酸鈣，它會膠結貝類（例如 [[ 牡蠣 ]] ）空殼碎片及其他生物死後遺留下來的骨骼並將其固定。當石灰藻類死後留下此一底質又為後來者所利用，如此周而復始慢慢地沈積而成藻礁。它累積的速率很慢，推估其厚度的年增長約在0.5mm以下，藻礁是一層一層鈣化組織經過漫長時間 [[ 堆積 ]] 而成，生長的速度並不快，要沈積到六十公分的厚度，可能至少需要兩千年以上的時間。

[[ 珊瑚礁 ]] 和藻礁都是生物造礁，最大的差別是在珊瑚礁是【動物】造礁，而藻礁是【植物】造礁。提起珊瑚礁，一般人不陌生；問起小朋友，有的還會興奮的加碼告訴你「 [[ 小丑魚 ]] 和 [[ 海葵 ]] 」的共生情趣。沒錯，珊瑚礁成長在水質清澈的海域，強烈日照導致旺盛的 [[ 光合作用 ]] 下，所形成的多孔隙環境是海中生物很好的棲息地，生態豐富異常，故有【海中熱帶 [[ 雨林 ]] 】之稱；但相對於動物造礁的珊瑚礁，以植物造礁的【藻礁】，也屬海岸多孔隙環境，同樣是海洋「生物的育嬰房」。他們在水質佳，水溫高的地方搶不過動物造礁，卻能在較惡劣的環境裡自成一片和珊瑚礁媲美；而藻類造礁過程緩慢，以 [[ 桃園 ]] 海岸造礁主體的【無節珊瑚藻】為例，20年還成長不到1公分，她比之珊瑚礁平均年成長1公分，實在是更為稀有特別。

石灰藻廣泛分布在海洋中，是極為重要的海洋植物，但全世界的海域中，以植物為主，而建造成大型之生物礁並不常見，曾有 [[ 化石 ]] 的報導，如 [[ 柴達木盆地 ]] 有古近紀-新近紀湖相疊層石與藻礁的 [[ 沉積 ]] 。現生的藻礁可見於 [[ 加勒比海 ]] 、 [[ 印度洋]]- [[ 太平洋 ]] 海域的小島向海面，海浪強大帶；也有分布於 [[ 加拿大 ]] 東部、 [[ 英國 ]] 、 [[ 挪威 ]] 之間的寒冷淺海域，或是出現在 [[ 地中海 ]] 、 [[ 澳洲 ]] 西部極度高鹽分的潟湖內，多為極端地帶，而且各具特色。全世界，以現生藻礁而言，無論分布面積或累積厚度，都是遠低於珊瑚礁的量，而有些表面雖是現生珊瑚藻，但內部可能是早期珊瑚碎屑或其他物質組成。雖然目前研究對於珊瑚礁過渡至藻礁的環境變化不甚清楚，但我們仍可以從臺灣海岸特性來看藻礁之形成，進而推測其分布範圍。

藻礁主要是由無節珊瑚藻膠結所形成的生物礁，礁體的結構類似珊瑚礁，但比較鬆軟，亦提供多孔隙的空間給其他生物棲息。若 [[ 富貴角 ]] 以西至桃園海岸的藻礁來看，不包括 [[ 浮游生物 ]] ，棲息在藻礁表面或潮池中，大型底棲動物即有 [[ 海綿動物門 ]] 、 [[ 扁形動物門 ]] 、 [[ 星蟲動物門 ]] 、 [[ 刺胞動物門 ]] 、 [[ 環節動物門 ]] 、 [[ 節肢動物門 ]] 、 [[ 軟體動物門 ]] 、 [[ 棘皮動物門 ]] 、 [[ 脊索動物門 ]] 等九大類。而不包括微細藻類，在藻礁表面肉眼可見，由多細胞構成的大型海藻即有紅藻門、綠藻門及褐藻門等三大類。