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科学分类又称科学分类法, 生物分类法，是用生物分类学方法来对生物的物种分组和归类的办法。以级别为基础的系统层次结构中使用的一个固定数量的层次，域、界、门、纲、目、科、属和种。无级别系统使用任意数量的层次。分类的群体被称为分类单元。

现代生物分类法源于林奈的系统，他根据物种共有的生理特征分类。在林奈之后，根据达尔文关于共同祖先的原则，此系统被逐渐改进。近年来，应用了生物信息学方法分析基因组DNA，正在大幅改动很多原有的分类。

生物分类法属于系统分类学。

现代发展

尽管林奈当时对生物分类只是为了方便鉴别，现在人们已经广泛赞同分类应反映出达尔文关于共同祖先的原则。

随著1960年代支序分类（cladistics），或称分支学说（cladism）的出现，一个分类单元被定位在演化树的某个位置。如果一个分类单元包括且仅包括某一个共同祖先的所有后代，称其为单系群（monophyly）；相对应的，若该单元包括其共同祖先，但未包括其所有后代，则称之为并系群（paraphyly）；若该分类不包括其最近共同祖先，则称之为复系群（polyphyly）。根据分支学说，一个自然分类应该是单系群而非并系或复系。

目前正在计划一种新的命名法，称做“PhyloCode”，用来处理演化支（clade）而非分类单元（拉丁文taxon，复数taxa）。现在仍不清楚，这种新的命名法能否和其它的命名法则并存。

传统的分类受到林奈的两界说影响甚深。即把生物一律分为动物和植物，又以王国(界)来称呼这两大分类，可在二十世纪对于微生物和真菌的研究，便被发现其不适用。第一次突破两界说是1925年以“王国（界）之上是帝国（域）”，借用政治和历史上的概念，创立“域”的最大分类单位，依照所有生物细胞的有无核，将之分为真核生物和原核生物两界。但本分类标准当时来说太过前卫了所以影响不大。

比较新的分类法中，域或称总界是最高的单元。三域系统最初被创立于1990年，此后逐渐被学界承认。目前，大多数学者已经接受了此系统，但仍有一些学者遵循五界系统。三域系统的基本特征是将原本在细菌界（或称原核生物界(Monera)中的古细菌和真细菌独立成细菌域（Bacteria）和古菌域（Archaea）。还有一些学者将古细菌列为第六个界但不接受三域系统。

早期分类系统

最早已知的对生命形式的分类系统由希腊哲学家亚里士多德所建立。他将动物根据运动方式（空中，陆上或水中）分类。1172年塞维利亚的法官伊本·路世德（ibn Rushd，即阿维罗伊Averroes）将亚里士多德的《论灵魂》（拉丁文de Anima）翻译成阿拉伯文并删节。其原始注解已佚，但由斯考特（Michael Scot）翻译的拉丁文版本仍流传。

在中国，明代李时珍（约1518–1593）在药典《本草纲目》中，将生物药材分为草部、谷部、菜部、果部、木部、虫部、鳞部、介部、禽部、兽部和人部。瑞士教授康拉德·格斯纳（Conrad Gesner, 1516–1565）将当时已知的生物进行了分析性的归纳。

新大陆的发现为欧洲带来了很多新奇的动物种类的描述和标本。在16世纪晚期和17世纪早期，人们开始对动物进行了详细描述，先是人们熟悉的种类，随后逐渐扩展，直到形成了基于解剖学基础的足够大的知识体系。这些解剖学知识主要来源于医学解剖学家，随后昆虫学家和最初的显微镜学者将分类的范围进一步扩大。

林奈氏分类法

卡尔·林奈（Carolus Linnaeus, 1707–1778）的巨著《自然系统》（拉丁文Systema Naturae）在其一生中被改编过12次（1735年第一版）。在此书中，自然界被划分为三个界：矿物、植物和动物。林奈用了四个分类等级：纲、目、属和种。

林奈所建立了用于命名所有物种的学名的方法，并沿用至今。在林奈之前，命名一个物种需要很长的包括许多单词的名称，其中包括了对物种的描述，并且这些名称不固定。林奈将物种名称统一成两个单词的拉丁文名称，即学名，由此分开了命名法和分类法。这种生物命名的方法称作双名法，具体命名办法和书写规则参见双名法条目。

目前，命名法由命名法规（Nomenclature Codes）所管理。命名包括了不同等级的分类单元的名称。

尽管在汉语中，各物种及分类单元有对应的汉语名称，但在学术上为了方便交流和避免一物多名或一名多物的问题发生，所有国家仍通用拉丁语的命名法，物种的学名也专指双名法的名称。拉丁语的好处在于，它基本已经是一种“死语”，不再用作口语，因此相对稳定。

举例

常见的五种细胞生物（果蝇、人、豌豆、酿酒酵母和大肠杆菌）的名称和分类如下：

中文	英文	拉丁文 (单数, 复数)	果蝇	人	豌豆	酿酒酵母	大肠杆菌
域；总界	domain; superkingdom	regio, regiones[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	真核域 Eukarya	真核域 Eukarya	真核域 Eukarya	真核域 Eukarya	细菌域 Bacteria
界	kingdom	regnum, regna[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	动物界 Animalia	动物界 Animalia	植物界 Plantae	真菌界 Fungi	细菌界 Bacteria
门	division（植物）; phylum（动物）	divisio, divisiones; phylum, phyla[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	节肢动物门 Arthropoda	脊索动物门 Chordata	被子植物门 Magnoliophyta	子囊菌门 Ascomycota	变形菌门 Proteobacteria
亚门	subdivision; subphylum	subdivisio, subdivisiones; subphylum, subphyla[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	六足亚门 Hexapoda	脊椎动物亚门 Vertebrata
纲	class	classis, classes[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	昆虫纲 Insecta	哺乳纲 Mammalia	双子叶植物纲 Dicotyledoneae	酵母纲 Saccharomycetes	γ-变形菌纲 Gammaproteobacteria
亚纲	subclass	subclassis, subclasses[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	新翅亚纲 Neoptera	兽亚纲 Eutheria	蔷薇亚纲 Rosidae
目	order	ordo, ordines[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	双翅目 Diptera	灵长目 Primates	豆目 Fabales	酵母目 Saccharomycetales	肠杆菌目 Enterobacteriales
亚目	suborder	subordo, subordines[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	短角亚目 Brachycera	简鼻亚目 Haplorrhini
科	family	familia, familiae[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	果蝇科 Drosophilidae	人科 Hominidae	豆科 Fabaceae	酵母科 Saccharomycetaceae	肠杆菌科 Enterobacteriaceae
亚科	subfamily	subfamilia, subfamiliae[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	果蝇亚科 Drosophilinae	人亚科 Homininae	蝶形花亚科 Faboideae
属	genus	genus, genera[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	果蝇属 Drosophila	人属 Homo	豌豆属 Pisum	酵母属 Saccharomyces	埃希氏菌属 Escherichia
种	species	species, species[[Category:含有Template:ISO 639 name la的条目]]	黑腹果蝇 D. melanogaster	智人 H. sapiens	豌豆 P. sativum	酿酒酵母 S. cerevisiae	大肠杆菌 E. coli

注：

• 表中很多分类尚有分歧，除细菌参照伯杰氏手册的分类大纲外，其馀按照传统分类，未有统一标准，谨作参考。

• 植物学和微生物学家用系统方法对较高级的分类单元命名，即用拉丁文中模式属（type genus）属名的词干加上标准的词尾来命名这个单元（见下表）。例如，蔷薇科的“科长”（即模式属）是蔷薇属(Rosa)，其词干为“Ros-”，则蔷薇科的拉丁名即为“Ros-”加上植物的科的后缀“-aceae”成为“Rosaceae”。中文的大多数分类单元也是类似用法，但：

• 1. 中文所用为高级单元的取名的属可能和拉丁文不同，如牻牛儿苗科(Geraniaceae)的中文名来源于牻牛儿苗属(Erodium)，但其拉丁名来源于老鹳草属(Geranium)。

• 1. 拉丁名变更后中文名不一定变更。如唇形科拉丁名原根据形态命名为Labiatae，现根据标准改为Lamiaceae，取名源自野芝麻属(Lamium)，中文也不必将唇形科改译作“野芝麻科”。

• 动物学家通常只将类似命名法命名至科（包括总科）这一级，以上则多用描述法。

视频

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